本研究通过整合scRNA-seq和snRNA-seq技术，揭示了杨树茎发育木质部形成过程中次生细胞壁沉积与程序性细胞死亡的转录协调机制，并证实早期细胞异质性更高，为复杂发育轨迹分析提供了新方法。 木质部发育是一个动态的、连续的过程，对木本植物的次生生长以及 ...

研究人员开发了R包TCGAimmunosurv，通过整合TCGA的bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，解决了癌症突变特异性生存分析与免疫细胞动态关联的难题。该工具实现了从突变筛选、生存相关基因鉴定到免疫亚型伪时序轨迹分析的闭环研究，为揭示驱动基因的临床-细胞双重机制 ...

随着科技的进步和技术的发展，我们对于生物世界的认识也越来越深入。单细胞转录组测序（single-cellRNA sequencing,scRNA-seq）技术作为分子生物学领域的重要突破，为我们揭开了单个细胞内部的转录组信息，帮助我们更好地理解生命的奥秘。本文将深入介绍scRNA-seq ...

2023年8月18日，温州医科大学苏建忠教授、西湖大学杨剑教授、哈尔滨工业大学张岩教授团队，在Cell Press细胞出版社期刊Cell Genomics上发表了题为“Polygenic regression uncovers traits-relevant cellular contexts through pathway activation transformation of ...

大家好！今天给大家介绍一篇2022年7月发表在frontiers in Immunology(IF:8.786)上的文章。本研究通过单细胞转录组数据集和bulk转录组分析鉴定HCC患者的三个亚型，并研究不同亚型的特征。 介绍：越来越多的研究表明免疫细胞间的相互作用和动态变化在肿瘤微环境的形成 ...

## 载入第0步准备好的表达矩阵，及细胞的一些属性（hclust分群，plate批次，检测到的基因数量） # 注意 变量a是原始的counts矩阵，变量 dat是log2CPM后的表达量矩阵。 ## 这个时候需要从多个维度来探索两个不同的plate的单细胞群体是否有明显的差别。 #set.seed()产生 ...