本文推荐研究人员开发的pyALRA工具,该Python实现解决了单细胞RNA测序(scRNA-seq)中技术性零值("dropout")的插补问题。通过采用自适应阈值低秩逼近(ALRA)算法,研究证明pyALRA在保持生物学零值的同时,显著提升了计算效率和内存使用率,为Python生态的单细胞分析提供了 ...
本文推荐研究人员关注单细胞分析领域的环境配置难题。为解决多工具依赖冲突、跨语言工作流整合及计算可重复性等问题 ...
生物信息学综合了数学、计算机科学和生物学的各类工具,通过处理生物带来的数据获得我们想要的信息从而进行预测。比如,在已知的序列里,用计算机找到它在哪个物种的哪个染色体上的哪个位置?或者是已知了特定序列,在另一些序列里预测组成成分。
基因组比较分析中,传统点阵图工具存在可视化灵活性不足的问题。日本久留米大学医学院的研究团队开发了基于Python 3的blastn2dotplots工具,通过Matplotlib库实现多序列独立子图绘制,支持自定义高亮区域、网格线和轴标签。该工具解决了现有工具需序列拼接导致 ...
The Mount Sinai Center for Transformative Disease Modeling (MSCTDM) at the Icahn School of Medicine at Mount Sinai, led by Prof. Bin Zhang, is seeking excellent candidates for Postdoctoral Fellows and ...
细胞在凋亡、坏死等过程中会向血液、尿液等体液中释放细胞游离DNA(cell-free DNA,cfDNA)。当机体发生癌症等疾病时,与疾病相关的细胞也会将DNA片段释放到体液中。通过检测cfDNA中的疾病相关信号实现疾病的无创筛查和诊断,是液体活检领域最具前景的技术 ...
说明:如果访问 GitHub 比较慢的话,可以关注我的知乎账号(Python-Jack),上面的“从零开始学Python”专栏(对应本项目前 20 天的内容)比较适合初学者,其他的专栏如“数据思维和统计思维”、“基于Python的数据分析”、“说走就走的AI之旅”等也在持续更新中 ...
Python的教程实在是太多了,这是三个质量比较高的,选一个看就可以了。 Python教程 - 廖雪峰的官方网站 Python 基础教程 | 菜鸟教程 简明 Python 教程 如果觉得不过瘾可以在(免费的编程书籍#Python - Github)找到更多的资料。 下面这篇文章强烈建议要看,学会使用搜索引擎能够帮助你解决大部分的编程 ...
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