本研究通过整合scRNA-seq和snRNA-seq技术,揭示了杨树茎发育木质部形成过程中次生细胞壁沉积与程序性细胞死亡的转录协调机制,并证实早期细胞异质性更高,为复杂发育轨迹分析提供了新方法。 木质部发育是一个动态的、连续的过程,对木本植物的次生生长以及 ...
本综述系统阐述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术在解析肺癌肿瘤异质性、肿瘤微环境(TME)及免疫细胞浸润等方面的前沿应用,重点探讨了其在生物标志物发现、患者分层及靶向治疗中的临床转化潜力,为克服非小细胞肺癌(NSCLC)治疗耐药性提供了新视角。
前列腺癌是指发生在前列腺的上皮性恶性肿瘤,是男性泌尿系统中发病率最高的肿瘤疾病。单细胞RNA测序(Single cell RNA sequencing, scRNA-seq)是一种在单细胞水平上利用RNA测序对特定细胞群体进行基因表达谱定量的高通量实验技术;空间转录组测序(Spatial ...
近期,中国农业科学院农业基因组研究所徐炜研究员团队开发了一种高通量、低成本R-loop定量图谱绘制技术mDRIP-seq,该研究成果以“mDRIP-seq is a high-throughput method for quantitative profiling of R-loop landscape”为题在Science Bulletin发表。
snRNA、scRNA傻傻分不清的时候,人家已经开始择优了,如今的单细胞有当年高通量测序之势,势不可挡,不得不用~小编就带大家看一下这篇2023年发表于《Plant Science》的文章。 植物单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术为深入了解基因表达调控机制和物种进化提供了有效 ...
随着科技的进步和技术的发展,我们对于生物世界的认识也越来越深入。单细胞转录组测序(single-cellRNA sequencing,scRNA-seq)技术作为分子生物学领域的重要突破,为我们揭开了单个细胞内部的转录组信息,帮助我们更好地理解生命的奥秘。本文将深入介绍scRNA-seq ...
近年来,将基因表达数据与空间信息相结合的空间转录组学迅速发展。随着该方法在肝脏研究中的应用,我们对于肝脏发育、再生和疾病的认识得到了极大的提高。虽然这一领域正不断发展进步,但仍需要解决灵敏度、获得精确单细胞信息、数据处理方法等各种 ...
## 载入第0步准备好的表达矩阵,及细胞的一些属性(hclust分群,plate批次,检测到的基因数量) # 注意 变量a是原始的counts矩阵,变量 dat是log2CPM后的表达量矩阵。 ## 这个时候需要从多个维度来探索两个不同的plate的单细胞群体是否有明显的差别。 #set.seed()产生 ...